San Fernando de Apure es la capital del estado desde 1854, fundada a orillas del río que da nombre a esta entidad llanera.
Según el historiador Virgilio Tosta, fue fundada el 28 de febrero de 1788 por orden del Gobernador de la antigua provincia de Barinas Don Fernando Miyares, cumplida por el fraile andaluz Buenaventura de Benaocaz, quien realizó tarea evangelizadora en los llanos de Cojedes, Barinas y Apure. A ambos se les atribuye la fundación de esta ciudad, ubicada en un privilegiado lugar, del otro lado del río Apure, punto de inicio para la penetración a los llanos del sur.
Su ubicación estratégica fue uno de los baluartes para que fuera elevada a la categoría de Villa el 21 de diciembre de 1793. San Fernando de apure tuvo importante actuación durante la Guerra de independencia, porque controlaba la encrucijada formada por las provincias de Barinas, Caracas y Guayana, por donde se producía todo el movimiento fluvial del sur de Venezuela.
Actualmente San Fernando de Apure, llamada “Ciudad de la Esperanza”, es la capital del Municipio Autónomo San Fernando.